應(yīng)我所廣大科研人員和研究生的要求，數(shù)量遺傳課題組將在作科所內(nèi)部舉辦一期“基因定位與育種設(shè)計(jì)”培訓(xùn)。內(nèi)容包括遺傳群體及其構(gòu)建、表型數(shù)據(jù)分析和遺傳力估計(jì)、群體和數(shù)量遺傳基礎(chǔ)、標(biāo)記間重組率估計(jì)和連鎖圖譜構(gòu)建、不同群體連鎖圖譜的整合、基因定位原理和方法、關(guān)聯(lián)分析原理和方法、無性系和多親群體的遺傳分析方法、全基因組選擇方法等，詳細(xì)日程和回執(zhí)附后。

參加人員為作科所遺傳育種領(lǐng)域的科研人員和研究生，具備遺傳學(xué)、育種學(xué)、生物統(tǒng)計(jì)和計(jì)算機(jī)等方面的基本知識；自帶安裝有Windows操作系統(tǒng)的筆記本電腦，鼓勵攜帶自己的遺傳群體或育種數(shù)據(jù)參會；提供簡單的工作午餐，不收取培訓(xùn)費(fèi)。本次培訓(xùn)班由2015年農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程-作物生物信息學(xué)及應(yīng)用團(tuán)隊(duì)經(jīng)費(fèi)贊助。

時(shí)間：2015年8月24 - 28日

地點(diǎn)：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所育種樓718會議室

規(guī)模：50人左右（報(bào)名截止時(shí)間為2015年8月10日；場地所限，超過50人時(shí)，按報(bào)名先后順序參加）

聯(lián)系人：錢亞紅（qianyahong@caas.cn; 86 10 82106038; 18001126271）

詳細(xì)日程
作息時(shí)間：上午9:00~12:30上課、12:30~13:30午餐、下午13:30~17:00上課
8月24日上午：以群體和數(shù)量遺傳學(xué)為主，內(nèi)容包括群體結(jié)構(gòu)估計(jì)，影響群體結(jié)構(gòu)的因素，表型數(shù)據(jù)方差分析和廣義遺傳力估計(jì)，遺傳效應(yīng)和遺傳方差的分解，親屬間的遺傳相關(guān)和遺傳交配設(shè)計(jì)，狹義遺傳力估計(jì)，遺傳進(jìn)度估計(jì)，相關(guān)遺傳進(jìn)度，選擇指數(shù)等；利用Excel進(jìn)行簡單的統(tǒng)計(jì)和遺傳分析等內(nèi)容。
8月24日下午：以兩點(diǎn)連鎖分析和QTL IciMapping軟件為主，內(nèi)容包括遺傳學(xué)基本規(guī)律，不同類型雙親群體的遺傳結(jié)構(gòu)，兩個(gè)連鎖座位之間的重組率估計(jì)；連鎖圖譜構(gòu)建和QTL做圖集成軟件QTL IciMapping功能介紹；利用QTL IciMapping軟件繪制連鎖圖譜（MapShow）、估計(jì)兩個(gè)座位間的重組率（2pointREC）、開展多環(huán)境表型鑒定數(shù)據(jù)方差分析（ANOVA）、利用表型數(shù)據(jù)估計(jì)性狀的廣義遺傳力（ANOVA）。
8月25日上午：以三點(diǎn)連鎖分析和圖譜構(gòu)建為主，內(nèi)容包括三個(gè)座位間的遺傳干涉和遺傳圖距，標(biāo)記分群和排序，遺傳圖譜與物理圖譜的關(guān)系，利用QTL IciMapping軟件去除冗余標(biāo)記（BIN）、構(gòu)建連鎖圖譜（MAP）、整合多條連鎖圖譜等內(nèi)容（CMP）。
8月25日下午：以加顯性QTL作圖為主，內(nèi)容包括QTL作圖的基本原理，單標(biāo)記QTL作圖方法，簡單區(qū)間作圖方法，利用QTL IciMapping軟件開展單標(biāo)記QTL作圖（BIP）、簡單區(qū)間作圖（BIP）。
8月26日上午：以加顯性QTL作圖為主，內(nèi)容包括背景遺傳變異控制的重要性，完備區(qū)間作圖原理和方法，QTL作圖中的兩類錯誤，不同QTL作圖方法的比較，利用QTL IciMapping軟件開展完備區(qū)間作圖（BIP）、模擬遺傳群體（BIP）、比較不同方法的QTL檢測功效（BIP）等內(nèi)容。
8月26日下午：以互作QTL作圖和染色體片段置換系群體為主，內(nèi)容包括上位型互作QTL作圖，QTL與環(huán)境的互作分析，選擇基因型分析，混合分離分析，染色體片段置換系群體的QTL作圖，巢式關(guān)聯(lián)群體的QTL作圖，利用QTL IciMapping軟件開展互作QTL作圖（BIP）、QTL與環(huán)境互作分析（MET）、染色體片段置換系群體QTL作圖（CSL）、巢式關(guān)聯(lián)群體QTL作圖（NAM）。
8月27日上午：以關(guān)聯(lián)分析方法為主，內(nèi)容包括連鎖不平衡的定義和計(jì)算，群體結(jié)構(gòu)對連鎖不平衡的影響，隨機(jī)交配對連鎖不平衡的影響，常見關(guān)聯(lián)分析方法；QTL作圖常見問題解析；利用Tassel軟件開展關(guān)聯(lián)分析。
8月27日下午：以多親群體和無性系物種的遺傳分析方法為主，內(nèi)容包括無性系遺傳群體的連鎖分析、連鎖圖譜構(gòu)建和基因定位方法，雙交群體的連鎖分析、連鎖圖譜構(gòu)建和基因定位方法，連鎖圖譜構(gòu)建和QTL做圖集成軟件GACD的功能介紹和使用（BIN、CDM、CDQ）。
8月28日上午：以育種模擬和育種設(shè)計(jì)為主，內(nèi)容數(shù)量遺傳的育種應(yīng)用，植物育種過程的建模和模擬，不同育種方法的模擬比較，已知基因信息的育種設(shè)計(jì)，利用QUGENE和QuLine軟件模擬育種過程等內(nèi)容。
8月28日下午：利用自己的群體和數(shù)據(jù)開展遺傳分析；自由討論和交流，包括對培訓(xùn)班的意見和建議，研究過程中遇到的遺傳學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)問題等。