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GACD 1.1版近日發(fā)布

點擊數(shù):??|??發(fā)表時間:2016-01-28

GACD是克隆F1和雙交群體的遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和數(shù)量性狀基因定位集成軟件,軟件采用最新的編程技術(shù),把不同功能包裝在一個工程中,用戶可以隨時查看已經(jīng)完成的各項操作,瀏覽已完成操作產(chǎn)生的各種結(jié)果,軟件界面更加友好、功能更加強(qiáng)大。軟件1.1版于20161月發(fā)布。

1.1版具有以下三個功能:1、刪除冗余標(biāo)記的BIN功能;2、克隆F1和雙交群體構(gòu)建連鎖圖譜的CDM功能;f、克隆F1和雙交群體QTL作圖的CDQ功能。

 

1.0版的不同之處

1、增加了表型缺少數(shù)據(jù)的表示方法,即用戶可以用“NA”、“na”、“*”、“.”表示缺失性狀值,原來的-100表示方法仍然有效;

2、BIN功能中,增加了根據(jù)奇異分離嚴(yán)重程度來刪除標(biāo)記的選項;

3CDM功能中,增加了按照指定分群數(shù)目的算法,并對參數(shù)界面做了調(diào)整;

4、CDQ功能中,簡單區(qū)間和完備區(qū)間兩種QTL定位方法的輸出結(jié)果中,增加了QTL位置上左右下降一個LOD值的置信區(qū)間;

5、CDQ功能中,所有QTL定位方法的輸出結(jié)果中,根據(jù)定位到QTL的信息,對單個QTL的貢獻(xiàn)率(即PVE)進(jìn)行矯正,矯正后的PVE具有可加性。