QTL IciMapping是遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和數(shù)量性狀基因定位集成軟件，軟件采用最新的編程技術(shù)，把不同功能包裝在一個(gè)工程中，用戶可以隨時(shí)查看已經(jīng)完成的各項(xiàng)操作，瀏覽已完成操作產(chǎn)生的各種結(jié)果，軟件界面更加友好、功能更加強(qiáng)大。軟件4.2版于2019年7月發(fā)布。

4.2版具有以下十大功能：1、多環(huán)境表型數(shù)據(jù)方差分析的AOV功能；2、基因型芯片檢測(cè)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換的SNP功能（將遺傳群體中個(gè)體或家系的AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TC、TG、GT數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為軟件需要的格式，用戶需要提供親本基因型才能利用此功能）；3、刪除冗余標(biāo)記的BIN功能；4、構(gòu)建連鎖圖譜的MAP功能；5、整合連鎖圖譜的CMP功能；6、奇異分離位點(diǎn)定位的SDL功能；7、雙親衍生群體QTL作圖的BIP功能；8、多環(huán)境表型鑒定數(shù)據(jù)QTL分析的MET功能；9、染色體片段置換系QTL作圖的CSL功能；10、巢式關(guān)聯(lián)分析群體QTL作圖的NAM功能。另外還提供兩個(gè)附加工具：1、繪制已構(gòu)建遺傳連鎖圖譜的MapShow工具；2、兩點(diǎn)重組率估計(jì)的2pointREC工具。

與4.1版的不同之處：

1、AOV功能中，增加了基因型和環(huán)境的穩(wěn)定性分析，優(yōu)化了非平衡表型數(shù)據(jù)（或部分表型缺失數(shù)據(jù)）的分析方法。

2、增加了基因型芯片檢測(cè)SNP數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)換功能，稱為SNP功能，作為軟件的第2個(gè)功能。該功能將遺傳群體中個(gè)體或家系的AA、TT、CC、GG、AT、AC、AG、TC、TG、GT數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為軟件需要的格式，用戶需要提供兩個(gè)純合親本的基因型數(shù)據(jù)才能利用此功能。

3、MAP功能中，成對(duì)重組率矩陣保存在一個(gè)臨時(shí)文件中，以提高大量標(biāo)記的處理能力，面前能處理的標(biāo)記數(shù)量可以達(dá)到數(shù)萬個(gè)；更多標(biāo)記的群體，建議先使用BIN功能去除冗余。

4、MAP和CMP功能中，對(duì)排序算法進(jìn)行了優(yōu)化。

5、同時(shí)提供32位和64位兩種版本。